Три тысячи лет назад злодей по имени Яотль в поисках источника мощной магии открыл межпланетный портал. Из портала вырвались ужасные чудовища, и Земля была практически уничтожена. Теперь Яотль вернулся и вновь собирается открыть портал. Но на пути зла встают отважные черепашки ниндзя. Удастся ли им остановить Яотля?