Die beeindruckenden Leistungssteigerungen in der Computertechnologie, die miniaturisierten automatischen Systeme und die mannigfachen Einsatzmoglichkeiten neuer Massenspektrometer ermoglichten den Ubergang von Einzel- zu Hochdurchsatzexperimenten in der modernen (Bio-)Analytik. Allerdings mangelt es noch an der Uberprufbarkeit der Ergebnisse aus diesen leistungsfahigen Methoden. Im Bereich der Proteomforschung werden oft automatische Datenbanksuchprogramme standardmassig zur Auswertung massenspektrometrischer Daten genutzt. Werden aber bei den herkommlichen Methoden zur Identifizierung von Peptiden und Proteinen aus komplexen Probenmischungen auch verifizierbare, validierte Ergebnisse erhalten? Der Autor Vinh An Thieu-Simchen gibt einfuhrend einen Uberblick uber seine verwendeten Techniken und stellt einige instrumentelle Parameter gegenuber. Anhand dieser Erkenntnisse analysiert er Faktoren, die eine Beurteilung der Resultate aus den automatischen Suchprogrammen beeinflussen. Dabei untersucht er neue Ansatze zur Verbesserung der massenspektrometrischen Proteomanalyse und entwickelt eine neue, optimierte Analysenmethode, die zu vertrauenswurdigen Ergebnissen fuhrt.

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