«Сидонии» удалось уничтожить корабль-кластер «Окарина», во многом благодаря Цумуги Сирауи — гибриду Гауна и человека. Но радость оказалась недолгой — большой корабль-кластер Гауна столкнулся со спутником седьмой планеты звездной системы Лема, на которой располагалась база колонистов.

На «Сидонии» решают: хватит уже убегать или трусливо надеяться, что враг их не тронет. Надо атаковать корабль-кластер первыми! И вот к девятой планете летит отряд перевооружившихся пилотов, и среди них — Идзана Синатосэ…