Раскрыты проблемы разработки методического инструментария развития предприятий инновационного сектора и формирования национатьной инновационной системы России на основе сетевой модели, стимулирующей взаимодействие организаций сферы науки, образования, производства и бизнеса. Разработан механизм интеграции науки, образования, производства и бизнеса, а также уточнено понятие «национачьная инновационная система»; обоснован экономический эффект от применения льготного налогообложения; определены условия развития и функционирования национальной инновационной системы России на основе территориальных и отраслевых инновационных кластерных объединений. Разработанные в монографии научно-методические и практические рекомендации нашли применение в деятельности реачьного предприятия, являющегося одновременно научно-исследовательским центром периметра крупной нефтяной компании и резидентом инновационного центра «Сколково». Монография может быть использована в учебном процессе вузов при изучении дисциплин «Инновационный менеджмент», «Управление инновациями», а также будет полезна менеджерам и руководителям государственных и коммерческих инновационных компаний.