L'annotation, qui consiste a identifier la position du ou des transcrits correspondant a chaque gene, est une phase incontournable de la valorisation de la sequence du genome. Plusieurs methodes ont ete proposees pour automatiser cette tache mais l'annotateur de reference reste l'expert humain. Celui-ci utilise ses connaissances en biologie pour interpreter une gamme de donnees provenant de diverses sources qu'il a accumulees automatiquement sur un locus particulier du genome, et applique ensuite un certain nombre de regles heuristiques a ces donnees. L'approche quasi manuelle de l'annotateur n'est toutefois pas applicable a l'ensemble des genomes eucaryotes, et nous avons donc cherche a developper une methode automatique qui suive le meme processus que l'expert humain. Pour ce faire, Exogean utilise des multi-graphes orientes acycliques colores (DACMs) ou les sommets sont des objets biologiques (exons, transcrits), et les multiples couleurs d'aretes entre les sommets sont des relations entre ces objets, derivees de l'expertise humaine. Les DACMs sont parcourus suivant des chemins qui repliquent les regles suivies par l'expert humain lorsqu'il analyse les donnees.

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